수박 과일썩음병균 (Acidovorax citrulli), 콩 불마름병균 (Xanthomonas axonopodis pv. glycines), 토마토/고추 세균성 점무늬병균 (X. campestris pv. vesicatoria),
식물병원세균의 병원성 관련 유전자/단백질 기능 연구
단백질체 (Proteomics) 분석 기법을 활용한 병원성 발현 현상 규명
메틸롬 (Methylome) 분석을 통한 세균에서 메틸화 효소 (Methyltransferase) 연구
| 연구주제 | 내용 |
|---|---|
| 1. 식물병원세균의 유전자/단백질 기능 및 표현형 분석 | 우리나라의 작물에 심각한 피해를 입히는 세균병원균의 유전자의 기능을 Marker Exchange Mutagenesis 혹은 In-Frame deletion 방법을 이용하여 돌연변이를 제작 후 병원성 검정을 통하여 유전자의 병원성 관여를 규명한다. 또한 병원세균의 운동성, biofilm 형성, 세포막 활성 등의 표현형적 분석을 수행하고 이에 따른 병원성관의 인과 관계를 연구한다. |
| 2. 병원성 관련 유전자/단백질 구조 및 단백질체 연구 | 식물병원세균의 단백질의 기능을 3차원 단백질 구조분석을 통해서 예측하고 이와 관련된 병원성 발현 기작을 Label free shotgun proteomics (LC-MS/MS) 기법을 이용하여 분석한다. 또한 Cluster of Ortholog Group 분석 등을 통하여 발현된 단백질의 분류 및 기능을 예측한다. 목적 단백질에 의해서 발현이 영향 받는 유전자/단백질을 분석함으로서 단백질의 정확한 기능 및 기작을 이해한다. 이러한 분석을 바탕으로 표현형적 분석과 함께 최종적으로는 병원균의 병원성 유도 모델을 예측함으로서 식물병을 관리하기 위한 방제점 확보를 주 목적으로 한다. |
| 3. 세균에서 메틸화효소 연구 | 최근에 중요성이 증대되고 있으나 진핵생물에 국한되어 있는 후성유전학적 연구를 세균에서 수행한다. 세균에 존재하는 메틸화효소 (Methyltransferase)를 중심으로 메틸화 효소의 효소학적 활성뿐만 아니라 SMRT (Single molecule real time) sequencing 을 사용하여 세균에서 메틸화 패턴을 분석한다. 진핵생물뿐만 아니라 원핵생물에서의 후성 유전학적 조절 기작을 규명하는 것이 주된 목표이다. 또한 식물병원세균의 유전체 및 단백질체 정보와 DNA 메틸화에 관한 연구를 접목시켜 현재까지 알려져 있지 않은 식물병원세균의 병원성 발현 기작을 밝히는 것을 목적으로 한다. |
